పరిశోధన ఆసక్తులు

జన్యు సంకేతం యొక్క అనువాదం సమయంలో అధిక విశ్వసనీయతను నిర్వహించడానికి కణంలో పనిచేసే ప్రత్యేకమైన ప్రూఫ్ రీడింగ్ విధానాల యొక్క యాంత్రిక ఆధారం మరియు క్రియాత్మక ఔచిత్యాన్ని అన్వేషించడంలో మా ప్రయోగశాల ఆసక్తి కలిగి ఉంది. రెండు క్రియాత్మక సందర్భాలలో ఉన్న D-అమైనోఅసిల్-tRNA డీసైలేస్ (DTD)-ఫోల్డ్‌పై మేము ప్రత్యేకంగా ఆసక్తి కలిగి ఉన్నాము a) ఆర్కియల్ థ్రెయోనిల్-tRNA సింథేటేజ్‌ల ఎడిటింగ్ మాడ్యూల్‌గా మరియు b) \’చిరల్ ప్రూఫ్ రీడింగ్ అంటే tRNAకి పొరపాటున జతచేయబడిన D-అమైనో ఆమ్లాలను తొలగించడానికి బాధ్యత వహించే ఫ్రీ స్టాండింగ్ డొమైన్‌గా. మేము ప్రస్తుతం సెల్ బయోలాజికల్‌ను ఉపయోగించి DTD యొక్క జీవ పాత్రను అలాగే డ్రోసోఫిలా మరియు మౌస్ వంటి మోడల్ సిస్టమ్‌లను ఉపయోగించి వివో విధానాలలో DTD యొక్క జీవ పాత్రను పరిశీలిస్తున్నాము. యంత్రాంగం బాగా అర్థం కాని రెండు ఇతర ప్రూఫ్ రీడింగ్ వ్యవస్థలపై నిర్మాణ జీవశాస్త్ర పని జరుగుతోంది.

ఎంచుకున్న ప్రచురణలు

కుమార్ పి, రాయ్ ఎ, ముకుల్ ఎస్జె, సింగ్ ఎకె, సింగ్ డికె, నల్లి ఎ, బెనర్జీ పి, బాబు కెఎస్డి, రామన్ బి, కృపారాణి ఎస్పి, సిద్దిఖీ ఐ, శంకరనారాయణన్ ఆర్. (2024) ఆర్కియల్ మూలం యొక్క అనువాద ప్రూఫ్ రీడర్ భూమి మొక్కలకు మల్టీఆల్డిహైడ్ ఒత్తిడి సహనాన్ని అందిస్తుంది eLife https://doi.org/10.7554/eLife.92827.2

కుమార్ P, బాబు KSD, సింగ్ AK, సింగ్ DK, నల్లి A, ముకుల్ SJ, రాయ్ A, మజీద్ M, రామన్ B, కృపారాణి SP, సిద్ధికీ I, శంకరనారాయణన్ R (2023) చిరల్ ప్రూఫ్ రీడర్‌ల యొక్క విభిన్న స్థానికీకరణ మొక్కలలో ఆర్గానెల్లర్ అనువాద సంఘర్షణను పరిష్కరిస్తుంది. Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 జూన్ 13;120(24):e2219292120. doi: 10.1073/pnas.2219292120. ఎపబ్ 2023 జూన్ 5. PMID: 37276405; PMCID: PMC10268278.

శివకుమార్ కె, వెంకడసామి విఎల్, అముధన్ జి, ఆన్ కెజె, గౌడ్ జికె, నాయని కె, గొగోయ్ జె, కుంచ ఎస్‌కె, మైంకర్ పిఎస్, కృపారాణి ఎస్‌పి, శంకరనారాయణన్ ఆర్ (2023) బయోసింథెటేస్ మరియు చిరల్ ప్రూఫ్ ప్రొటీన్ సమయంలో అలనైల్-టిఆర్‌ఎన్‌ఎ సింథటేస్ యొక్క ఎన్‌యాంటియోసెలెక్టివిటీ యొక్క డిజైన్ సూత్రాలు మరియు క్రియాత్మక ఆధారం. న్యూక్లియిక్ యాసిడ్స్ Res. 2023 ఏప్రిల్ 24;51(7):3327-3340. doi: 10.1093/nar/gkad205. PMID: 36951106; PMCID: PMC10123102.

మండల్, ఎస్., కినతుకర, పి., సింగ్, ఎస్., శాంభవి, ఎస్., పాటిల్, జి.ఎస్., దూబే, ఎన్., సింగ్, ఎస్.హెచ్., పాల్, బి., శేఖర్, పి.సి., కామత్, ఎస్.ఎస్., శంకరనారాయణన్, ఆర్. (2022) యూకారియోట్లలో డయాసిల్‌గ్లిసరాల్ లిపిడ్ హోమియోస్టాసిస్ యొక్క ప్రత్యేకమైన నియంత్రకం DIP2. elife doi: 10.7554/eLife.77665.

కుమార్, పి., భట్నాగర్, ఎ. & శంకరనారాయణన్, ఆర్. (2022) ప్రోటీన్ బయోసింథసిస్ సమయంలో చిరల్ ప్రూఫ్ రీడింగ్ మరియు దాని పరిణామాత్మక చిక్కులు. FEBS లెట్ DOI: 10.1002/1873-3468.14419

గొగోయ్, జె., భట్నాగర్, ఎ., ఆన్, కె.జె., పొట్టాబతిని, ఎస్., సింగ్, ఆర్., మజీద్, ఎం., కుంచ, ఎస్.కె., కృపారాణి, ఎస్.పి., శంకరనారాయణన్, ఆర్. (2022) వైరుధ్యం ఉన్న బ్యాక్టీరియా DTD-tRNA కోడ్‌ను మార్చడం చాలా అవసరం. సైన్స్ అడ్వా. 8, eabj7307, 1-9. doi: 10.1126/sciadv.abj7307.